Inspiré par les vies et les expériences de plusieurs membres de la Garde civile directement impliqués dans la lutte contre le terrorisme et ancré dans le contexte historique, politique et social des années 1990 et 2000, Un fantasma en la Batalla raconte l'histoire d'Amaia, une jeune garde civile qui passe plus de dix ans à travailler comme agent infiltrée au sein de l'ETA, dans le but de localiser les cachettes du groupe dans le sud de la France.